弘历等人离开寺院，推理分析《洗髓经》藏于藏经阁中，三人决定夜闯藏金阁。
深夜，藏经阁大火，李聪儿和高五于阁中为了经书缠斗，高五败走，李聪儿重伤。千钧一发之际弘历赶到将李聪儿从大火中救出。到了外面，弘历才发现不论真经书、假经书都是白纸。此时突然火势顺着风向朝经堂方向蔓延，方丈大急，原来真的《洗髓经》藏在经堂里。
弘历更果断冲进火场抢出《洗髓经》，方丈大为感动，决定把《洗髓经》借给他。李遵明气急，待弘历等人离去，便出手杀死方丈。
弘历遭到弘时手下和高五的追杀，与叶沧云、宋田田走散，《洗髓经》也被高五夺取半本。
雍正得知弘历失踪，怀疑他中了弘时之计，痛斥弘时，命令弘时去山东救弘历回宫，否则弘时也不必回来。弘时只能答应，也暂时消解了雍正的怒气。
弘历逃入太和县，被杨县令当成土匪抓进大牢。
廉亲王指使高五一定要在牢狱之内弄死弘历。高五买通牢头石青，找到弘历同牢房的犯人余三，想在牢中毒死弘历。与此同时，弘时也发密信给杨知县，要置弘历于死地。
另一方面，叶沧云和宋田田回到盐帮，打探到弘历遭劫杀，并在太和县境内失踪，心急如焚。盐帮帮主宋知庸知道《洗髓经》一事凶险，不让女儿卷入其中。宋田田在丫鬟春萍的帮助下逃出盐帮，和叶沧云一起来到太和县，正好遇到弘历的贴身侍卫高庆喜，三人伺机救出弘历。
余三下毒被弘历识破。弘历索性表明自己的身份，取得了余三的信任。
功夫乾隆分集剧情介绍第五集弘时秘密来到太和县，吩咐杨县令务必弄死弘历，杨县令指使手下将弘历单独关押，并百般虐待。
宋田田等三人向一名书摊老板打听弘历下落，确定弘历在大牢内。
高庆喜想尽办法自求入狱，遇到余三，却发现弘历已经被单独关押。宋田田乔装进入牢房，见到弘历和高庆喜。叶沧云和宋田田找到唐门传人穿山甲，欲挖地道救出弘历。宋田田设法将此消息送给弘历，让其做好准备。
杨知县按照弘时的命令，欲将弘历问斩。行刑前穿山甲挖地道赶来救援，不料被弘时察觉，救援失败。宋田田和叶沧云无法，只好劫法场救弘历。谁知高五从斜刺里杀出，从刑场上劫走弘历。
李聪儿跟踪高五，半路将其打昏。弘历乘机逃走，还从高五身上找回了半本《洗髓经》。
功夫乾隆分集剧情介绍第六集叶沧云等人救走高庆喜和余三，刑场大乱。弘时气得暴跳如雷，勒令杨知县关闭城门挨家挨户搜查。弘历误打误撞走进本县的驿站，巧遇忠厚的劳驿丞，驿丞得知弘历的真实身份，自告奋勇帮他送信，不料被杨知县所擒。弘时循着线索来到驿站，射伤弘历，将其擒获。
明月阁阁主苏千玦来到其帮派据点。命李聪儿放走弘历。李聪儿大为不解，苏千玦告她此举是放长线钓大鱼，《洗髓经》不仅是武林秘籍，更关系到清廷的龙脉宝藏，只有取得弘历信任，才能顺藤摸瓜从雍正口中搞清宝藏的秘密。
穿山甲领众人从地道逃生，谁知在地下走错了方向，进入县衙之中，误打误撞从弘时手中救出弘历。众人通过错综复杂的地道来到城门口，弘时赶来截杀，幸亏李聪儿和盐帮宋知庸等人赶到，李聪儿掩护众人逃跑。杨县令死于乱战之中。弘时命令封锁消息，火速将弘历杀死。
